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Un nuevo proyecto busca entender una forma frecuente de leucemia en niños con síndrome de Down

Un proyecto dirigido por el Dr. Sergi Cuartero, investigador del Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras, ha sido premiado por la Sociedad Americana de Hematología (ASH) en los ASH Global Research Award 2022. El Dr. Cuartero es uno de los 13 jóvenes investigadores galardonados en estos premios. Su proyecto pretende entender mejor las bases moleculares de la leucemia mieloide en pacientes con Síndrome de Down (ML-DS) y contribuir en la identificación de nuevas dianas de uso terapéutico en la ML-DS.

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IGEM UB

El equipo VESIPROD trabaja con el laboratorio del Dr. Gaël Roué para presentar su prototipo a la competición iGEM de biología sintética

Un grupo de estudiantes de la Universidad de Barcelona participan en la edición 2022 de la IGEM, el concurso internacional de biología sintética que celebrará su gran Jamboree el próximo 26 de octubre. Bajo el nombre de vesiprod, el equipo cuenta con la colaboración del Dr. Gaël Roué para desarrollar un nuevo sistema basado en exosomas en la lucha contra el linfoma de Burkitt.

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Oscar Molina 2021

Un nuevo método desarrollado por investigadores del Instituto Josep Carreras predice el riesgo de recaída en niños con leucemia LLA-B con hiperdiploidía

Un equipo internacional liderado por el Dr. Oscar Molina y el Dr. Pablo Menéndez, del Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras, identifica anomalías cromosómicas asociadas a la recaída en un subtipo frecuente de leucemia linfoblástica aguda de células B (LLA-B), una condición grave que afecta especialmente a niños. Este descubrimiento puede ayudar a identificar desde el diagnóstico aquellos pacientes que tienen un mayor riesgo de sufrir una recaída y darles tratamientos más adecuados, anticipando así la reaparición del cáncer.

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Laura Mondragón

Investigadores del Instituto Josep Carreras estudiarán un linfoma raro de células T gracias a la Leukemia Research Foundation

La Dra. Laura Mondragón, líder del grupo del Linfoma de células T en el Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras, ha sido asignada con un nuevo proyecto para luchar contra el linfoma angioinmunoblástico de células T (AITL). Este proyecto, que se inicia el 1 de octubre de 2022, está financiado por la Leukemia Research Foundation basada en Northfield, Illinois (EEUU), y tiene como objetivo explotar modelos animales de última generación para el AITL, con el fin de comprender mejor este tipo linfoma adulto y abrir la puerta a nuevos enfoques terapéuticos.

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El proyecto sobre pro-B-ALL liderado por la Dra. Maribel Parra es seleccionado por el Hub Pediátrico i4KIDS como finalista de su programa de innovación

Con el objetivo de potenciar la innovación pediátrico-maternal, se concederá una ayuda al grupo de investigación Desarrollo y enfermedades linfocíticas, liderado por la Dra. Maribel Parra, para estudiar la leucemia linfoblástica aguda (ALL) derivada de progenitores de linfocitos B (pro-B-ALL), el tipo de leucemia más diagnosticada en pacientes pediátricos en los países occidentales.

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Dr. Esteller & Dra. Pujol (IDIBELL)

Descubiertos factores epigenéticos asociados a un síndrome grave en COVID-19 infantil

Investigadores del grupo de Epigenética del Cáncer del Dr. Manel Esteller del Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras y la Dra. Aurora Pujol, del Instituto de Investigación Biomédica de Bellvitge (IDIBELL), han identificado una firma epigenética asociada al desarrollo del Síndrome Inflamatorio Multisistémico en Niños (MISC) que aparece tras la infección del virus SARS-CoV-2. La firma ha sido llamada EPIMISC, siguiendo la línea de los estudios previos sobre la epigenética del COVID-19 realizados por el mismo equipo.

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David Corujo

Cáncer vs. Sistema Inmune: macroH2A, una proteína de la cromatina, puede volver las células cancerosas insensibles a las órdenes inmunes

Los investigadores del Buschbeck Lab y del IGTP están impulsando nuestra comprensión del papel de las variantes de la histona macroH2A en la progresión del cáncer y la comunicación de las células cancerosas con el sistema inmune. En un artículo de investigación publicado recientemente en la revista Cell Reports, el equipo identificó dos áreas diferentes donde las variantes de macroH2A pueden actuar cuando las células cancerosas están expuestas a citoquinas, la maquinaria de señalización inmune: la regulación de la cromatina de la expresión génica y la secreción de señalización autocrina.

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Francesc Solé 2022

Se incorpora información genética de pacientes con síndrome mielodisplásico a la última actualización del índice internacional de evaluación de riesgo, el IPSS-M

Tres investigadores del Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras, el Dr. Francesc Solé y la Dra. Laura Palomo del grupo de Síndromes Mielodisplásicos, y la Dra. Lurdes Zamora del grupo de Neoplasias Mieloides, han participado en el consorcio internacional que ha desarrollado el nuevo índice de pronóstico molecular para los Síndromes Mielodisplásicos, el IPSS-M. Esta nueva herramienta, que se presentó en NEJM Evidence, una nueva revista del grupo editorial New England Journal of Medicine , permitirá una mejor estratificación del riesgo del paciente y por lo tanto un mejor tratamiento, adaptado a las necesidades individuales.

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M Graupera, A Angulo-Urarte

When, where and which PIK3CA mutations are pathogenic in congenital disorders

Nature Cardiovascular Research 8 Ago 2022, 2022 . Epub 8 Ago 2022
PIK3CA encodes the class I PI3Kα isoform and is frequently mutated in cancer. Activating mutations in PIK3CA also cause a range of congenital disorders featuring asymmetric tissue overgrowth, known as the PIK3CA-related overgrowth spectrum (PROS), with frequent vascular involvement. In PROS, PIK3CA mutations arise postzygotically, during embryonic development, leading to a mosaic body pattern distribution resulting in a variety of phenotypic features. A clear skewed pattern of overgrowth favoring some mesoderm-derived and ectoderm-derived tissues is observed but not understood. Here, we summarize our current knowledge of the determinants of PIK3CA-related pathogenesis in PROS, including intrinsic factors such as cell lineage susceptibility and PIK3CA variant bias, and extrinsic factors, which refers to environmental modifiers. We also include a section on PIK3CA-related vascular malformations given that the vasculature is frequently affected in PROS. Increasing our biological understanding of PIK3CA mutations in PROS will contribute toward unraveling the onset and progression of these conditions and ultimately impact on their treatment. Given that PIK3CA mutations are similar in PROS and cancer, deeper insights into one will also inform about the other.
Adema V, Ma F, Kanagal-Shamanna R, Thongon N, Montalban-Bravo G, Yang H, Peslak SA, Wang F, Acha P, Sole F, Lockyer P, Cassari M, Maciejewski JP, Visconte V, Ganan-Gomez I, Song Y, Bueso-Ramos C, Pellegrini M, Tan TM, Bejar R, Carew JS, Halene S, Santini V, Al-Atrash G, Clise-Dwyer K, Garcia-Manero G, Blobel GA, Colla S

Targeting the EIF2AK1 signaling pathway rescues red blood cell production in SF3B1-mutant myelodysplastic syndromes with ringed sideroblasts.

Blood Cancer Discov 4 Ago 2022, . Epub 4 Ago 2022
SF3B1 mutations, which occur in 20% of patients with myelodysplastic syndromes (MDS), are the hallmarks of a specific MDS subtype, MDS with ringed sideroblasts (MDS-RS), which is characterized by the accumulation of erythroid precursors in the bone marrow and primarily affects the elderly population. Here, using single-cell technologies and functional validation studies of primary SF3B1-mutant MDS-RS samples, we show that SF3B1 mutations lead to the activation of the EIF2AK1 pathway in response to heme deficiency and that targeting this pathway rescues aberrant erythroid differentiation and enables the red blood cell maturation of MDS-RS erythroblasts. These data support the development of EIF2AK1 inhibitors to overcome transfusion dependency in patients with SF3B1-mutant MDS-RS with impaired red blood cell production.
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Lucas Pontel, Alberto Bueno-Costa, Agustín E. Morellato, Juliana Carvalho Santos, Gaël Roué, Manel Esteller

Acute lymphoblastic leukemia necessitates GSH-dependent ferroptosis defenses to overcome FSP1-epigenetic silencing

Redox Biology 31 Jul 2022, 2022 (102408) 2213-2317. Epub 31 Jul 2022
Ferroptosis is a form of cell death triggered by phospholipid hydroperoxides (PLOOH) generated from the iron-dependent oxidation of polyunsaturated fatty acids (PUFAs). To prevent ferroptosis, cells rely on the antioxidant glutathione (GSH), which serves as cofactor of the glutathione peroxidase 4 (GPX4) for the neutralization of PLOOHs. Some cancer cells can also limit ferroptosis through a GSH-independent axis, centered mainly on the ferroptosis suppressor protein 1 (FSP1). The significance of these two anti-ferroptosis pathways is still poorly understood in cancers from hematopoietic origin. Here, we report that blood-derived cancer cells are selectively sensitive to compounds that block the GSH-dependent anti-ferroptosis axis. In T and B acute lymphoblastic leukemia (ALL) cell lines and patient biopsies, the promoter of the gene coding for FSP1 is hypermethylated, silencing the expression of FSP1 and creating a selective dependency on GSH-centered anti-ferroptosis defenses. In-trans expression of FSP1 increases the resistance of leukemic cells to compounds targeting the GSH-dependent anti-ferroptosis pathway. FSP1 over-expression also favors ALL-tumor growth in an in vivo chick chorioallantoic membrane (CAM) model. Hence, our results reveal a metabolic vulnerability of ALL that might be of therapeutic interest.
Azagra A, Meler A, de Barrios O, Tomás-Daza L, Collazo O, Monterde B, Obiols M, Rovirosa L, Vila-Casadesús M, Cabrera-Pasadas M, Gusi-Vives M, Graf T, Varela I, Sardina JL, Javierre BM, Parra M

The HDAC7-TET2 epigenetic axis is essential during early B lymphocyte development.

Nucleic Acids Res 29 Jul 2022, . Epub 29 Jul 2022
Correct B cell identity at each stage of cellular differentiation during B lymphocyte development is critically dependent on a tightly controlled epigenomic landscape. We previously identified HDAC7 as an essential regulator of early B cell development and its absence leads to a drastic block at the pro-B to pre-B cell transition. More recently, we demonstrated that HDAC7 loss in pro-B-ALL in infants associates with a worse prognosis. Here we delineate the molecular mechanisms by which HDAC7 modulates early B cell development. We find that HDAC7 deficiency drives global chromatin de-condensation, histone marks deposition and deregulates other epigenetic regulators and mobile elements. Specifically, the absence of HDAC7 induces TET2 expression, which promotes DNA 5-hydroxymethylation and chromatin de-condensation. HDAC7 deficiency also results in the aberrant expression of microRNAs and LINE-1 transposable elements. These findings shed light on the mechanisms by which HDAC7 loss or misregulation may lead to B cell-based hematological malignancies.
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Robles-Rebollo I, Cuartero S, Canellas-Socias A, Wells S, Karimi MM, Mereu E, Chivu AG, Heyn H, Whilding C, Dormann D, Marguerat S, Rioja I, Prinjha RK, Stumpf MPH, Fisher AG, Merkenschlager M

Cohesin couples transcriptional bursting probabilities of inducible enhancers and promoters.

Nat Commun 27 Jul 2022, 13 (1) 4342. Epub 27 Jul 2022
Innate immune responses rely on inducible gene expression programmes which, in contrast to steady-state transcription, are highly dependent on cohesin. Here we address transcriptional parameters underlying this cohesin-dependence by single-molecule RNA-FISH and single-cell RNA-sequencing. We show that inducible innate immune genes are regulated predominantly by an increase in the probability of active transcription, and that probabilities of enhancer and promoter transcription are coordinated. Cohesin has no major impact on the fraction of transcribed inducible enhancers, or the number of mature mRNAs produced per transcribing cell. Cohesin is, however, required for coupling the probabilities of enhancer and promoter transcription. Enhancer-promoter coupling may not be explained by spatial proximity alone, and at the model locus Il12b can be disrupted by selective inhibition of the cohesinopathy-associated BET bromodomain BD2. Our data identify discrete steps in enhancer-mediated inducible gene expression that differ in cohesin-dependence, and suggest that cohesin and BD2 may act on shared pathways.
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