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News

Laura Mondragón

Investigadores del Instituto Josep Carreras estudiarán un linfoma raro de células T gracias a la Leukemia Research Foundation

La Dra. Laura Mondragón, líder del grupo del Linfoma de células T en el Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras, ha sido asignada con un nuevo proyecto para luchar contra el linfoma angioinmunoblástico de células T (AITL). Este proyecto, que se inicia el 1 de octubre de 2022, está financiado por la Leukemia Research Foundation basada en Northfield, Illinois (EEUU), y tiene como objetivo explotar modelos animales de última generación para el AITL, con el fin de comprender mejor este tipo linfoma adulto y abrir la puerta a nuevos enfoques terapéuticos.

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El proyecto sobre pro-B-ALL liderado por la Dra. Maribel Parra es seleccionado por el Hub Pediátrico i4KIDS como finalista de su programa de innovación

Con el objetivo de potenciar la innovación pediátrico-maternal, se concederá una ayuda al grupo de investigación Desarrollo y enfermedades linfocíticas, liderado por la Dra. Maribel Parra, para estudiar la leucemia linfoblástica aguda (ALL) derivada de progenitores de linfocitos B (pro-B-ALL), el tipo de leucemia más diagnosticada en pacientes pediátricos en los países occidentales.

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Dr. Esteller & Dra. Pujol (IDIBELL)

Descubiertos factores epigenéticos asociados a un síndrome grave en COVID-19 infantil

Investigadores del grupo de Epigenética del Cáncer del Dr. Manel Esteller del Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras y la Dra. Aurora Pujol, del Instituto de Investigación Biomédica de Bellvitge (IDIBELL), han identificado una firma epigenética asociada al desarrollo del Síndrome Inflamatorio Multisistémico en Niños (MISC) que aparece tras la infección del virus SARS-CoV-2. La firma ha sido llamada EPIMISC, siguiendo la línea de los estudios previos sobre la epigenética del COVID-19 realizados por el mismo equipo.

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David Corujo

Cáncer vs. Sistema Inmune: macroH2A, una proteína de la cromatina, puede volver las células cancerosas insensibles a las órdenes inmunes

Los investigadores del Buschbeck Lab y del IGTP están impulsando nuestra comprensión del papel de las variantes de la histona macroH2A en la progresión del cáncer y la comunicación de las células cancerosas con el sistema inmune. En un artículo de investigación publicado recientemente en la revista Cell Reports, el equipo identificó dos áreas diferentes donde las variantes de macroH2A pueden actuar cuando las células cancerosas están expuestas a citoquinas, la maquinaria de señalización inmune: la regulación de la cromatina de la expresión génica y la secreción de señalización autocrina.

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Francesc Solé 2022

Se incorpora información genética de pacientes con síndrome mielodisplásico a la última actualización del índice internacional de evaluación de riesgo, el IPSS-M

Tres investigadores del Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras, el Dr. Francesc Solé y la Dra. Laura Palomo del grupo de Síndromes Mielodisplásicos, y la Dra. Lurdes Zamora del grupo de Neoplasias Mieloides, han participado en el consorcio internacional que ha desarrollado el nuevo índice de pronóstico molecular para los Síndromes Mielodisplásicos, el IPSS-M. Esta nueva herramienta, que se presentó en NEJM Evidence, una nueva revista del grupo editorial New England Journal of Medicine , permitirá una mejor estratificación del riesgo del paciente y por lo tanto un mejor tratamiento, adaptado a las necesidades individuales.

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Graupera paper miransertib

Un nuevo modelo experimental rápido y fiable para las malformaciones vasculares apunta al miransertib como una opción terapéutica prometedora

Un equipo de investigadores liderado por la Dra. Sandra Castillo y la Dra. Mariona Graupera, del Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras y miembros del CIBERONC, ha descubierto que el inhibidor de AKT miransertib podría ser un nuevo tratamiento molecular eficaz contra las malformaciones vasculares de bajo flujo, un hito largamente esperado. Sus resultados, publicados en la revista EMBO Molecular Medicine, se basan en un nuevo modelo in vivo de crecimiento de los vasos sanguíneos (angiogénesis) que podría convertirse en un referente para este tipo de estudios a corto plazo.

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Manel Esteller & Alberto Bueno 2

Hallado un mecanismo que explica cómo una célula cancerosa se convierte en una normal

Un nuevo estudio describe cómo células leucémicas altamente proliferativas acaban convirtiéndose en células normales que ya no se multiplican, al cambiar las modificaciones químicas, la llamada epigenética, de un tipo de material genético: el ARN mensajero. El artículo se ha publicado en la reconocida revista Leukemia y lo firma Alberto Bueno-Costa, investigador del grupo del Dr. Manel Esteller, supervisor del estudio y director del Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras, investigador ICREA y catedrático de la Universidad de Barcelona.

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Damiana Álvarez-Errico

La mielopoyesis in vitro de iPSCs se asemeja a la formación temprana de la sangre y abre la puerta a nuevas oportunidades terapéuticas para el cáncer y las enfermedades inflamatorias

Un equipo coordinado por el Wellcome Sanger Institute y el Instituto de Investigación contra la leucemia Josep Carreras ha desarrollado un robusto mapa celular de la diferenciación de las Células Madre Pluripotentes Inducidas (iPSC) en macrófagos, que recapitula fielmente las primeras etapas de la diferenciación mieloide. Esta guía de la diferenciación mieloide temprana supone un paso esencial para comprender mejor las etapas iniciales de la hematopoyesis, que están en gran medida inexploradas en los seres humanos, y abrirá nuevas oportunidades en terapias celulares.

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Veronica Davalos, Carlos A. García-Prieto, Gerardo Ferrer, Sergio Aguilera-Albesa, Juan Valencia-Ramos, Agustí Rodríguez-Palmero, Montserrat Ruiz, Laura Planas-Serra, Iolanda Jordan, Iosune Alegría, Patricia Flores-P erez, Veronica Cantarín, Victoria Fumado, Maria Teresa Viadero, Carlos Rodrigo, Maria Méndez-Hernández, Eduardo Lopez-Granados, Roger Colobran, Jacques G. Riviere, Pere Soler-Palacín, Aurora Pujol, Manel Esteller

Epigenetic profiling linked to multisystem inflammatory syndrome in children (MIS-C): A multicenter, retrospective study

Lancet eClinicalMedicine 25 Jun 2022, 50 .
Background: Most children and adolescents infected with the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) remain asymptomatic or develop a mild coronavirus disease 2019 (COVID-19) that usually does not require medical intervention. However, a small proportion of pediatric patients develop a severe clinical condition, multisystem inflammatory syndrome in children (MIS-C). The involvement of epigenetics in the control of the immune response and viral activity prompted us to carry out an epigenomic study to uncover target loci regulated by DNA methylation that could be altered upon the appearance of MIS-C. Methods: Peripheral blood samples were recruited from 43 confirmed MIS-C patients. 69 non-COVID-19 pediatric samples and 15 COVID-19 pediatric samples without MIS-C were used as controls. The cases in the two groups were mixed and divided into discovery (MIS-C = 29 and non-MIS-C = 56) and validation (MIS-C = 14 and non-MIS-C = 28) cohorts, and balanced for age, gender and ethnic background. We interrogated 850,000 CpG sites of the human genome for DNA methylation variants. Findings: The DNA methylation content of 33 CpG loci was linked with the presence of MIS-C. Of these sites, 18 (54.5%) were located in described genes. The top candidate gene was the immune T-cell mediator ZEB2; and others highly ranked candidates included the regulator of natural killer cell functional competence SH2D1B; VWA8, which contains a domain of the Von Willebrand factor A involved in the pediatric hemostasis disease; and human leukocyte antigen complex member HLA-DRB1; in addition to pro-inflammatory genes such as CUL2 and AIM2. The identified loci were used to construct a DNA methylation profile (EPIMISC) that was associated with MIS-C in both cohorts. The EPIMISC signature was also overrepresented in Kawasaki disease patients, a childhood pathology with a possible viral trigger, that shares many of the clinical features of MIS-C. Interpretation: We have characterized DNA methylation loci that are associated with MIS-C diagnosis. The identified genes are likely contributors to the characteristic exaggerated host inflammatory response observed in these patients. The described epigenetic signature could also provide new targets for more specific therapies for the disorder.
Ramos-Muntada M, Trincado JL, Blanco J, Bueno C, Rodríguez-Cortez VC, Bataller A, López-Millán B, Schwab C, Ortega M, Velasco P, Blanco ML, Nomdedeu J, Ramírez-Orellana M, Minguela A, Fuster JL, Cuatrecasas E, Camós M, Ballerini P, Escherich G, Boer J, denBoer M, Hernández-Rivas JM, Calasanz MJ, Cazzaniga G, Harrison CJ, Menéndez P, Molina O

Clonal heterogeneity and rates of specific chromosome gains are risk predictors in childhood high-hyperdiploid B-cell acute lymphoblastic leukemia

Molecular Oncology 21 Jun 2022, . Epub 21 Jun 2022
B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) is the commonest childhood cancer. High hyperdiploidy (HHD) identifies the most frequent cytogenetic subgroup in childhood B-ALL. Although hyperdiploidy represents an important prognostic factor in childhood B-ALL, the specific chromosome gains with prognostic value in HHD-B-ALL remain controversial, and the current knowledge about the hierarchy of chromosome gains, clonal heterogeneity and chromosomal instability in HHD-B-ALL remains very limited. We applied automated sequential-iFISH coupled with single-cell computational modeling to identify the specific chromosomal gains of the eight typically gained chromosomes in a large cohort of 72 primary diagnostic (DX, n=62) and matched relapse (REL, n=10) samples from HHD-B-ALL patients with either favorable or unfavorable clinical outcome in order to characterize the clonal heterogeneity, specific chromosome gains and clonal evolution. Our data show a high degree of clonal heterogeneity and a hierarchical order of chromosome gains in DX samples of HHD-B-ALL. The rates of specific chromosome gains and clonal heterogeneity found in DX samples differ between HHD-B-ALL patients with favorable or unfavorable clinical outcome. In fact, our comprehensive analyses at DX using a computationally-defined risk predictor revealed low levels of trisomies +18+10 and low levels of clonal heterogeneity as robust relapse risk factors in minimal residual disease (MRD)-negative childhood HHD-B-ALL patients: relapse-free survival beyond 5-years: 22.1% vs 87.9%, P<0.0001 and 33.3% vs 80%, P<0.0001, respectively. Moreover, longitudinal analysis of matched DX-REL HHD-B-ALL samples revealed distinct patterns of clonal evolution at relapse. Our study offers a reliable prognostic sub-stratification of pediatric MRD-negative HHD-B-ALL patients.
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David Corujo, Roberto Malinverni, Juan Carrillo-Reixach, Oliver Meers, Arce Garcia-Jaraquemada, Marguerite-Marie Le Panne´rer, Vanesa Valero, Ainhoa Pérez, Álvaro Del Río-Álvarez, Laura Royo, Beatriz Pérez-González, Helena Raurell, Rafael D. Acemel, José M. Santos-Pereira, Marta Garrido-Pontnou, José Luis Gómez-Skarmeta, Lorenzo Pasquali, Josep Manyé, Carolina Armengol, Marcus Buschbeck

MacroH2As regulate enhancer-promoter contacts affecting enhancer activity and sensitivity to inflammatory cytokines

Cell Reports 21 Jun 2022, 39 (12) .
MacroH2A histone variants have a function in gene regulation that is poorly understood at the molecular level. We report that macroH2A1.2 and macroH2A2 modulate the transcriptional ground state of cancer cells and how they respond to inflammatory cytokines. Removal of macroH2A1.2 and macroH2A2 in hepatoblastoma cells affects the contact frequency of promoters and distal enhancers coinciding with changes in enhancer activity or preceding them in response to the cytokine tumor necrosis factor alpha. Although macroH2As regulate genes in both directions, they globally facilitate the nuclear factor κB (NF-κB)-mediated response. In contrast, macroH2As suppress the response to the pro-inflammatory cytokine interferon gamma. MacroH2A2 has a stronger contribution to gene repression than macroH2A1.2. Taken together, our results suggest that macroH2As have a role in regulating the response of cancer cells to inflammatory signals on the level of chromatin structure. This is likely relevant for the interaction of cancer cells with immune cells of their microenvironment.
Zhang YW, Mess J, Aizarani N, Mishra P, Johnson C, Romero-Mulero MC, Rettkowski J, Schönberger K, Obier N, Jäcklein K, Woessner NM, Lalioti ME, Velasco-Hernandez T, Sikora K, Wäsch R, Lehnertz B, Sauvageau G, Manke T, Menendez P, Walter SG, Minguet S, Laurenti E, Günther S, Grün D, Cabezas-Wallscheid N

Hyaluronic acid-GPRC5C signalling promotes dormancy in haematopoietic stem cells.

Nat Cell Biol 20 Jun 2022, . Epub 20 Jun 2022
Bone marrow haematopoietic stem cells (HSCs) are vital for lifelong maintenance of healthy haematopoiesis. In inbred mice housed in gnotobiotic facilities, the top of the haematopoietic hierarchy is occupied by dormant HSCs, which reversibly exit quiescence during stress. Whether HSC dormancy exists in humans remains debatable. Here, using single-cell RNA sequencing, we show a continuous landscape of highly purified human bone marrow HSCs displaying varying degrees of dormancy. We identify the orphan receptor GPRC5C, which enriches for dormant human HSCs. GPRC5C is also essential for HSC function, as demonstrated by genetic loss- and gain-of-function analyses. Through structural modelling and biochemical assays, we show that hyaluronic acid, a bone marrow extracellular matrix component, preserves dormancy through GPRC5C. We identify the hyaluronic acid-GPRC5C signalling axis controlling the state of dormancy in mouse and human HSCs.
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Estupiñán-Moreno E, Ortiz-Fernández L, Li T, Hernández-Rodríguez J, Ciudad L, Andrés-León E, Terron-Camero LC, Prieto-González S, Espígol-Frigolé G, Cid MC, Márquez A, Ballestar E, Martín J

Methylome and transcriptome profiling of giant cell arteritis monocytes reveals novel pathways involved in disease pathogenesis and molecular response to glucocorticoids.

Ann Rheum Dis 15 Jun 2022, . Epub 15 Jun 2022
Giant cell arteritis (GCA) is a complex systemic vasculitis mediated by the interplay between both genetic and epigenetic factors. Monocytes are crucial players of the inflammation occurring in GCA. Therefore, characterisation of the monocyte methylome and transcriptome in GCA would be helpful to better understand disease pathogenesis.
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