Biografia

Angelika Merkel és una bioinformàtica experimentada amb formació en biologia molecular i més de 15 anys d’experiència en dades òmiques. Inicialment es va formar com a biòloga molecular a la Universitat de Constança (Alemanya) entre 2000-2003. De 2004 a 2009, va estudiar a la Universitat de Canterbury (Nova Zelanda), on va obtenir un títol en Ecologia Molecular i va completar el seu doctorat en Biologia. Durant el seu doctorat, va treballar en l'evolució de seqüències curtes d'ADN repetitiu en llevats i va passar del “wet lab” al “dry lab”, i va adquirir habilitats de programació a través de formació especialitzada i autoaprenentatge.

Des de 2010, Angelika ha estat principalment basada a Barcelona i ha treballat en diversos projectes de gran volum de dades, inclosos els projectes ENCODE i BLUEPRINT, que han proporcionat les bases per l'anàlisi del transcriptoma i epigenoma en humans, específicament en l’hematopoesi i les seves malignitats associades. Mentre treballava en el projecte ENCODE al Centre de Regulació Genòmica (CRG, Barcelona) sota la direcció de Roderic Guigo, va participar en el desenvolupament del línia d'anàlisi de RNA-seq i la caracterització de la transcripció específica de tipus cel·lular i el splicing alternatiu, que va portar a la noció que fins al 75% del genoma humà està realment transcrit (de mitjana, el 57% en un tipus cel·lular determinat). Més tard, treballant al Centre Nacional d’Anàlisi Genòmica (CNAG) sota la direcció de Simon Heath, va participar en el desenvolupament d'una línia d'anàlisi de seqüenciació per bisulfit per estudiar la metilació de l'ADN durant la salut i la malaltia. La seva participació en l'anàlisi de la diferenciació de cèl·lules sanguínies normals i malignes (com a part de BLUEPRINT) la va portar a descobrir que la dràstica pèrdua de metilació observada prèviament en alguns càncers es deriva, de fet, de signatures de diferenciació sanes en limfòcits.

Des de 2020, dirigeix la plataforma de Bioinformàtica a l’IJC. Està interessada en la recerca de la regulació epigenòmica de l'expressió gènica durant la salut i la malaltia, particularment en el càncer. La seva passió és desenvolupar eines i mètodes bioinformàtics per la recerca biomèdica. És experta en fluxos de treball bioinformàtics, gestió de dades i descobriment de biomarcadors.

ORCHID ID: 0000-0001-5164-6803