Biografía

Angelika Merkel es una bioinformática experimentada con formación en biología molecular y más de 15 años de experiencia trabajando con datos ómicos. Inicialmente se formó como bióloga molecular en la Universidad de Constanza (Alemania) entre 2000-2003. De 2004 a 2009, estudió en la Universidad de Canterbury (Nueva Zelanda) donde obtuvo un título en Ecología Molecular y completó su doctorado en Biología. Durante su doctorado, trabajó en la evolución de secuencias cortas de ADN repetitivo en levaduras y pasó del “wet lab” al “dry lab”, habiendo adquirido habilidades de programación a través de formación especializada y autoaprendizaje.

Desde 2010, Angelika ha estado principalmente basada en Barcelona y ha trabajado en varios proyectos con gran volumen de datos, incluidos los proyectos ENCODE y BLUEPRINT, que han proporcionado las bases para el análisis del transcriptoma y epigenoma en humanos, específicamente en la hematopoyesis y sus malignidades asociadas. Mientras trabajaba en el proyecto ENCODE en el Centro de Regulación Genómica (CRG, Barcelona) bajo la dirección de Roderic Guigo, participó en el desarrollo de la línea de análisis RNA-seq y la caracterización de la transcripción específica de cada tipo celular y el splicing alternativo, lo que llevó a la noción de que hasta el 75% del genoma humano está transcrito (una media del 57% en un tipo celular determinado). Posteriormente, trabajando en el Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG) bajo la dirección de Simon Heath, participó en el desarrollo de una línea de análisis de secuenciación por bisulfito para estudiar la metilación del ADN durante la salud y la enfermedad. Su participación en el análisis de la diferenciación de células sanguíneas normales y malignas (como parte de BLUEPRINT) le llevó a descubrir que la drástica pérdida de metilación observada previamente en algunos cánceres se deriva, de hecho, de firmas de diferenciación sanas en linfocitos.

Desde 2020, dirige la plataforma de Bioinformática en el IJC. Está interesada en la investigación de la regulación epigenómica de la expresión génica durante la salud y la enfermedad, particularmente en el cáncer. Su pasión es desarrollar herramientas y métodos bioinformáticos para la investigación biomédica. Es experta en flujos de trabajo bioinformáticos, gestión de datos y descubrimiento de biomarcadores.

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