El 2022, el Consorci d'Anàlisi Clínica Proteòmica de Tumors (CPTAC per les seves sigles en anglès) va investigar les cèl·lules canceroses, caracteritzades per patir grans alteracions, i va explicar com les mutacions a l'ADN es tradueixen en proteïnes alterades, que són les responsables del comportament anòmal d'aquestes cèl·lules canceroses (més informació enaquesta notícia) Ara, el mateix consorci ha trobat proves que molts pacients amb càncer van heretar dels seus progenitors aquestes variants genètiques que modifiquen proteïnes.

L'estudi, publicat recentment a la prestigiosa revista Cell, explora els efectes de les variants de la línia germinal en proteomes de pacients amb càncer, és a dir, el conjunt complet de proteïnes expressades en les seves cèl·lules. Amb dades de més de 1.000 pacients i de 10 tipus diferents de càncer, aquesta recerca és una de les més exhaustives realitzades fins ara sobre la relació entre les mutacions genètiques heretades i els mecanismes moleculars que impulsen el càncer. Kathleen J. Imbach i el Dr. Eduard Porta, membres del grup d’Inmunogenómica del Càncer en l'Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras, signen la publicació com a coautora principal i cosupervisor sènior, respectivament.

L'estudi aprofita els amplis conjunts de dades generades pel CPTAC, que inclouen informació genòmica, transcriptòmica, proteòmica, acetilòmica i fosfoproteòmica, per avaluar l'impacte de més de 337.000 variants de la línia germinal en l'expressió i funció de les proteïnes. L'equip va identificar 119 variants de la línia germinal, tant rares com comunes, en gens clau del càncer que alteren l'estructura i abundància de les proteïnes. Es va descobrir que aquestes variants afecten processos crítics en el desenvolupament del càncer, com l'estabilitat de les proteïnes, les modificacions posttraduccionals i la senyalització cel·lular.

Aquests descobriments subratllen la importància de les variants de la línia germinal no només en l'augment del risc de càncer, sinó també en la configuració de la biologia del propi tumor. La integració de dades proteòmiques i genòmiques va permetre a l'equip de recerca mapejar aquestes mutacions hereditàries directament en les dades proteiques específiques de cada pacient, i això els va permetre entendre millor com aquestes variants contribueixen al desenvolupament i la progressió tumoral.

Aquest és un dels punts clau d’aquesta nova recerca, ja que l'enfocament proteogenòmic, o "peptidòmica de precisió", segons els autors i les autores, els va permetre anar més enllà de la pura anàlisi d'associació i comprendre realment com moltes variants genètiques diferents, que no són nocives per si soles, poden acabar tenint un impacte significatiu en el risc de patir càncer.

En detallar com aquests factors genètics influeixen en el comportament de les proteïnes, l'estudi obre noves vies per al desenvolupament de teràpies personalitzades contra el càncer i estratègies de prevenció.

La recerca ha estat finançada per l'Institut Nacional del Càncer dels EUA, el Ministeri de Ciència, Innovació i Universitats d'Espanya i la Fundació CRIS contra el Càncer (Espanya). Aquesta notícia ha estat elaborada amb l'ajuda d'eines d'intel·ligència artificial generativa.

Article de referència: Martins Rodrigues, F. et al. (2025) ‘Precision proteogenomics reveals pan-cancer impact of germline variants’, Cell 188, 1–24 May 1, 2025 ª 2025 The Author(s). Published by Elsevier Inc `https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.03.026