Inmunogenómica del cáncer

Eduard Porta

Equipo
Publicaciones
Ayudas vigentes

INTRODUCCIÓN

Nuestra investigación se encuentra en la interfase entre la inteligencia artificial, la biología molecular y la oncología médica, y reunimos a expertos de los tres campos. Empleamos estrategias computacionales para estudiar la interacción entre variantes genéticas en genomas cancerosos, además de múltiples aspectos del cáncer que abarcan desde la respuesta inmunitaria a los tumores hasta la susceptibilidad de las células cancerosas a diferentes tratamientos.

NUESTRA INVESTIGACIÓN

En las dos últimas décadas, en la investigación del cáncer se ha producido un gran auge de tres tipos principales de "big data". Así, en nuestro grupo usamos tres tipos de datos:

1. Genotipos de línea germinal de pacientes con cáncer, es decir, el genoma básico no alterado de personas individuales a las que se les ha diagnosticado un cáncer.

2. Genomas de tumores somáticos, que son los genomas particulares de tumores individuales, con su conjunto único de alteraciones.

3. La cantidad y la composición de células tumorales obtenidas mediante secuenciación de células únicas.

Hasta ahora, estos tres aspectos de la inmunobiología de los tumores se han estudiado principalmente de manera individual. No obstante, ahora resulta evidente que estos tres factores están íntimamente relacionados y que deben estudiarse como un todo.

NUESTROS OBJETIVOS

Nuestro principal objetivo es comprender cómo influye la variación genética en la respuesta inmunitaria contra las células cancerosas y viceversa. Más específicamente, estamos trabajando en las siguientes líneas de investigación:

1. Comprender cómo influyen las variantes genéticas heredadas en la respuesta inmunitaria contra las células cancerosas.

2. Comprender la relación entre las variantes genéticas heredadas y el sexo biológico en cuanto a su influencia sobre la predisposición al cáncer. Estamos utilizando el superordenador MareNostrum para analizar datos genéticos de cientos de miles de pacientes con cáncer desde la perspectiva del sexo biológico para identificar variantes genéticas que predispongan al cáncer de manera diferente según el género.

3. Integración de la estructura de las proteínas y de datos genéticos para identificar nuevas mutaciones asociadas al cáncer.

4. Creación de un mapa molecular y celular del microambiente tumoral en el cáncer de vejiga.