El desenvolupament tecnològic és clau per millorar la forma en què es diagnostica i tracta el càncer hematològic. Amb aquesta visió, l'Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras aposta per nous sistemes que desborden els límits de les tecnologies òmiques. La Transcriptòmica Espacial, el punt de trobada entre la genòmica, la transcriptòmica i la microscòpia avançada, n'és una.

La Transcriptòmica Espacial permet conèixer què fa cada cèl·lula d'un tall histològic, en relació amb les altres. Així, hom pot veure – literalment – ​​quins marcadors moleculars són presents a cadascuna de les cèl·lules d'una biòpsia, en la seva posició real, i comprendre de manera molt més detallada l'estructura del tumor. Aquesta comprensió, més profunda, permetrà als investigadors clínics desenvolupar noves estratègies terapèutiques ultrapersonalitzades, impensables fins ara.

Tanmateix, aquesta metodologia és tan recent que encara no hi ha un estàndard, cosa que perjudica seriosament la reproductibilitat dels experiments, un pilar del sistema científic. Per solucionar-ho, l'equip de Spatial Biology de l'Institut Josep Carreras, liderat pel Dr. Eduard Porta i la Dra. Daniela Grases, ha condensat l'experiència de les seves més de 1000 mostres analitzades a la primera guia pràctica de Transcriptòmica Espacial, recentment publicada a la revista Trends in Biotechnology.

Segons Grases, "El ràpid creixement de la Transcriptòmica Espacial fa que molts grups es trobin amb obstacles pràctics: elecció de la plataforma, qualitat de les mostres, profunditat de seqüenciació, etc." per això, l'equip ofereix consells sobre com corregir errors comuns i “integrar la metodologia de manera robusta i reproduïble”.

La publicació cobreix tots els elements clau d'un experiment de Transcriptòmica Espacial, com ara la definició de la pregunta biològica, el nombre òptim de mostres, la selecció de la plataforma tecnològica adequada i la manera com el personal ha de processar i interpretar les dades.

En opinió de Grases, el futur de la Transcriptòmica Espacial és “la seva integració als fluxos de treball clínic, com un element més dels protocols de treball hospitalaris amb patologia rutinària, per facilitar el diagnòstic de pacients”. Un futur ambiciós, ja que la tecnologia encara està en desenvolupament i la seva implementació és, actualment, econòmicament inviable a causa dels costos de materials i de personal, altament especialitzat.

Gràcies al desenvolupament de noves eines d'anàlisi, molt més potents que les que s'utilitzen actualment, ens trobem a les portes d'una revolució en el diagnòstic dels càncers hematològics. Aquest serà més ràpid, precís i personalitzat, punts clau pels quals aposta l'Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras per assolir la missió fundacional: acabar amb el càncer sanguini.

Aquest treball ha estat finançat en part pel Ministeri de Ciència d'Espanya, la Fundació Josep Carreras contra la Leucèmia i la Fundació FERO-ASEICA. No s'han fet servir eines d'IA generativa a la redacció d'aquesta notícia.

Article de referència: Daniela Grases, Eduard Porta-Pardo, “A practical guide to spatial transcriptomics: lessons from over 1000 samples”. Trends in Biotechnology, 2025, ISSN 0167-7799, https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2025.08.020