Introducción

La Unidad de Single Cell tiene como objetivo proporcionar servicios científicos a la comunidad del Instituto Josep Carreras y está equipada con tecnología puntera para aplicar la tecnología "single-cell" a estudios básicos y traslacionales en genómica y transcriptómica. Los enfoques "single cell" nos permiten identificar poblaciones de células que serían imposibles de aislar mediante técnicas con menos resolución utilizadas previamente como la secuenciación en masa, así como caracterizar dichas poblaciones de células e identificar diferencias a nivel genético y fenotípico en tejidos tumorales.

Por tanto, estas técnicas permiten revelar la heterogeneidad celular de los tumores y ayudan a identificar células resistentes a los tratamientos estándar o que son más susceptibles de proliferar.

Servicios

ChromiumTM Controller (10x Genomics):

• Secuenciación de ARN de células únicas (expresión génica)
• Secuenciación de ARN de células únicas (expresión génica) + Funcionalidad de lectura de códigos de barras
• Creación de perfiles inmunitarios de células únicas (GEX 5’ + TCR/BCR)
• Secuenciación ATAC de células únicas
• Single-cell Multiome (ATAC + GEX)

Transcriptómica espacial (10X Genomics):

• Visium Spatial Gene Expression para tejidos congelados en fresco (FF)
• Visium Spatial Gene Expression para tejidos FFPE
• Visium CytAssist Spatial Gene Expression para tejidos FF y FFPE

Tapestri Platform (Mission Bio):

• Secuenciación de ADN dirigida de células únicas (análisis de mutaciones)
• Secuenciación de ADN dirigida de células únicas (análisis de mutaciones + análisis CNV)
• Secuenciación de ADN de células únicas + Análisis de proteínas de la superficie celular