8 d'octubre de 2020

Noves comunitats de enhancers aïllades en l'espai 3D

El Grup d'Organització 3D de Cromatina de l'Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras dirigit per Biola M. Javierre ha revelat recentment, en una investigació conjunta, que les comunitats d'enhancers altament connectades actuen com a impulsors clau dels programes genètics específics de llinatge.

El Grup d'Organització 3D de Cromatina de l'Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras dirigit per Biola M. Javierre, en una investigació conjunta amb la U. of Southern Denmark, Babraham Institute, Odense University Hospital i l'U. Florida State, ha revelat recentment que les comunitats de enhancers altament connectades actuen com a impulsors clau dels programes genètics específics de llinatge.

En aquest estudi, publicat a Nature Genetics, els autors van utilitzar la captura de conformació de cromatina d'alt rendiment (Hi-C) per explorar el interactoma dels enhancers durant la adipogènesi i la osteogènesi i van demostrar que les comunitats de enhancers connectades són dinàmiques durant la diferenciació cel·lular i que aquesta dinàmica està acoblada a la seva activitat. Els enhancers connectats estan units per factors de transcripció homotípics, el que suggereix una estabilització per interacció creuada dels factors de transcripció. Totes aquestes troballes suggereixen que les interaccions intervingudes per enhancers regulen la funció potenciadora i, per tant, la diferenciació cel·lular. 

Més informació: Madsen, J.G.S., Madsen, M.S., Rauch, A. et al. Highly interconnected enhancer communities control lineage-Determining gens in human mesenchymal stem cells. Nat Genet (2020).