13 de març de 2020

L'experiència CHROME

Dos investigadors del Grup Cromatina, Metabolisme i Destí Cel·lular de l'Institut Josep Carreras expliquen la seva experiència com a estudiants de CHROME, un projecte europeu de la modalitat Innovative Training Networks Marie Skłodowska-Curie.

Els estudiants de doctorat Iva Guberovic i Michael Maher, investigadors del grup Cromatina, Metabolisme i Destí Cel·lular de l'Institut de Recerca Josep Carreras, dirigit per Marcus Buschbeck, expliquen en una entrevista la seva experiència en el projecte europeu Chromatin and Metabolism interactions as targets for healthy living (CHROME).

Aquest projecte forma part de la modalitat de Xarxes de Formació Innovadora (ITN) i d'una Acció Marie Skłodowska-Curie finançada per la Comissió Europea. El seu objectiu és formar, a través d'una xarxa internacional de centres públics i privats, a una nova generació d'investigadors creatius i innovadors, capaços de transformar el coneixement i idees en productes i serveis per a benefici socioeconòmic de la Unió Europea.

CHROME reuneix 15 investigadors en l'etapa inicial de diversos camps de recerca. El seu objectiu és aprofundir en la interacció entre metabolisme i epigenètica, en el context de la salut humana. Per això combinen investigació bàsica i ciència traslacional, explorant aspectes com el microbioma intestinal, el ritme circadià i la leucèmia. Aquest projecte ofereix a aquests estudiants oportunitats de formació per tota Europa, adscripcions i tutories intersectorials, i grans oportunitats per establir contactes.

Iva Guberovic, estudiant croata de doctorat en Biomedicina de la Universitat de Barcelona, ​​és una entusiasta dels principis bàsics de la comunicació entre orgànuls cel·lulars, amb un interès particular en la relació entre la cromatina i el metabolisme.

Michael Maher, originari d'Irlanda, va viatjar a Barcelona per treballar com a tècnic de laboratori i finalment va trobar el seu camí a l'Institut Josep Carreras com a doctorand del laboratori de Marcus Buschbeck. Està interessat en la regulació epigenètica del metabolisme dels lípids en la leucèmia.

Tots dos estudiants comparteixen les seves experiències.

Quines respostes busqueu amb la vostra investigació en el projecte CHROME?

Iva Guberovic (IG): Com pot la cromatina percebre directament els canvis en el metabolisme? Principalment a través d'un grup selecte de variants d'histones anomenades variants d'histones macroH2A.

Michael Maher (MM): Jo busco quins factors epigenètics i modeladors de la cromatina regulen el metabolisme dels lípids en la leucèmia. Les cèl·lules leucèmiques utilitzen els greixos com una potent font de combustible, la qual cosa permet una major proliferació i resistència als medicaments. Si identifiquem els aspectes reguladors del metabolisme dels lípids, podem desenterrar pistes sobre els possibles objectius de les teràpies que són específiques per a les cèl·lules leucèmiques.

Quins progressos heu aconseguit amb el vostre treball de recerca?

IG: Durant els últims tres anys, hem trobat un parell de nous i excitants aspectes de les variants de la histona macroH2A, que m'han apropat a respondre les preguntes centrals del meu projecte de doctorat.

MM: En el meu cas, he produït dos conjunts de dades que identifiquen factors epigenètics potencials implicats en el metabolisme dels lípids, i les diferències d'expressió genètica entre les cèl·lules de baixa i alta absorció d'àcids grassos. L'enfocament basat en la citometria de flux que hem adoptat per mesurar i separar les cèl·lules en funció de la seva absorció d'àcids grassos és també un mètode innovador per estudiar el metabolisme dels lípids en les cèl·lules de leucèmia. 

Què us ha permès formar part del projecte CHROME?

IG: El trasllat al laboratori Ladurner a Munic em va permetre aprendre sobre biofísica, un camp científic que era completament nou per mi. La meva recerca és molt interdisciplinària i involucra mètodes de biofísica, bioquímica, in cellulo i in vivo. No obstant això, la part essencial de CHROME són les persones involucrades. CHROME ha estat una part integral del meu projecte, que m'ha permès abordar les meves preguntes de recerca des de moltes vessants, gràcies a l'experiència i la interdisciplinarietat de la xarxa. També m'ha proporcionat experiències extraordinàries, grans amics i una gran família d'investigadors en la qual sé que podré confiar en el futur.

MM: La ciència és un esforç comunitari i és molt més que fer experiments al laboratori. CHROME m’ha obert moltes portes a noves col·laboracions, exposició a conferències internacionals, i compartir i desenvolupar noves idees amb companys i líders de grup. Vaig tenir la fantàstica oportunitat de passar un parell de mesos amb un grup de laboratori col·laborador a Suïssa, on vaig aprendre noves tècniques per mesurar el metabolisme, així com l’experiència de treballar en un nou entorn de treball.

Quins són els propers passos de la vostra recerca?

IG: Estic planejant acabar el meu doctorat en un any en el qual col·laboraré intensament amb els investigadors de CHROME per tota Europa. Desprès d’això, planejo quedar-me en el món de la recerca de la cromatina i el metabolisme, comptant sempre amb les persones que he conegut durant la magnífica experiència de CHROME.

MM: En general, m’agradaria comprovar si les associacions entre el metabolisme dels lípids i els factors epigenètics que hem observat en les línies cel·lulars de la leucèmia en el laboratori són també evidents en mostres de pacients. El meu pla és acabar la meva tesi, i amb sort defendre-la a finals del 2020.